Сідэраты з'яўляюцца эфектыўным інструментам для павышэння ўрадлівасці глебы, аднак іх разлажэнне можа дапамагчы размножванню шкодных патагенаў, такіх як шэрая гніль і фузарыум. Для барацьбы з гэтай праблемай рэкамендуецца выкарыстоўваць трыходерму — карысны грыб, які перашкаджае замацаванню патагенаў на раслінных астанках. Ужыванне трыходермы магчыма ў розных формах, такіх як трихосан або трыходерма на мёдзе, а таксама яе можна вырасціць самастойна з закваскі. Дастаткова адной чайнай лыжкі прэпарата на квадратны метр, які трэба ўнесці да сяўбы сідэратаў, падчас іх росту або пасля касьбы. Трыходерма не толькі абараняе расліны, але і пераўтварае раслінныя астанкі ў ўдобрэнне, павялічваючы эфектыўнасць сідэратаў у 100 разоў. Рэкамендуецца выкарыстоўваць сідэраты ў спалучэнні з трыходэрмай для дасягнення здаровага і ўрадлівага ўчастка.