Музей истории города Мельник является филиалом Санданского археологического музея . Он входит в число ста национальных туристических объектов .
С 1968 года по начало 90-х годов 20 века музей располагался в знаменитом Доме Паши , построенном в начале 19 века. Позже экспозицию перенесли в другое здание, отреставрированное в 2015 году. В музее имеется этнографическая выставка, посвященная образу жизни, культуре и основному промыслу болгар из Пиринской Македонии — виноделию . На выставке представлены находки из региона, относящиеся ко всем эпохам, от доисторических времен до современности. Богатая экспозиция представляет городской тип культуры и быт греческих семей Мельника в эпоху Возрождения . Интересен акцент на артефактах, связанных с производством вина – мельничных бочках, аксессуарах и фотографиях, связанных с обработкой и хранением мельничного вина.
С 1992 года в музее разместилось около 5000 экспонатов.