Дзеянне гульні Metro: Last Light адбываецца ў 2034 годзе, праз год пасля падзей папярэдняй часткі, Metro 2033. У гульні Ордэн «Спарта» займае ваенны аб'ект Д6, які з'яўляецца велізарным і яшчэ не цалкам даследаваным бункерам. Галоўны герой, Арцём, які стаў спартанцам у папярэдняй гульні, адчувае сумневы наконт сваіх дзеянняў, звязаных з забойствам Чорных. У метро распаўсюджваюцца чуткі пра адкрыццё Д6 і яго багаццях, што прыцягвае ўвагу канкурэнтных груповак: камуністычнай Чырвонай лініі і фашысцкага Чацвёртага Рэйха, якія імкнуцца захапіць бункер і яго ўтрыманне.