Дзеянне гульні Metro: Last Light разгортваецца ў 2034 годзе, праз год пасля падзей Metro 2033. У гульні прадстаўлены Ордэн «Спарта», які займае ваенны аб'ект Д6, раней наведаны галоўным героем Артёмам. Д6 з'яўляецца велізарным і яшчэ не цалкам даследаваным бункерам. Артём, які стаў спартанцам у папярэдняй частцы, адчувае няўпэўненасць і сумняваецца ў правільнасці свайго рашэння забіць Чорных. У метро распаўсюджаюцца чуткі пра багацці Д6, што прыводзіць да канфлікту паміж спартанцамі і канкурэнтнымі групоўкамі — камуністычнай Чырвонай лініяй і фашысцкім Чацвёртым райхам, якія імкнуцца захапіць бункер.