Shadow Hearts — гэта гульня, якая расказвае пра Юрыя Хьюге, сына рускай жанчыны Анны і японскага салдата Джынпачиро. Юрый нарадзіўся ў Японіі, але хутка яго сям'я пераехала ў Кітай, дзе яго бацька працягваў службу і ўдзельнічаў у вайне супраць відзьма Дэхуая. Галоўны герой абяцае бацьку абараняць сваю маці, пакуль той на службе. Падчас штарму на вёску нападаюць слугі відзьмы, і Анна гіне, спрабуючы выратаваць сына. У момант адчаю і яркасці ў Юрыя прасыпаюцца надзвычайныя здольнасці, і ён ператвараецца ў Імператара смерці, мстячы нападаючым на яго сям'ю.